Protein–RNA interactions for Protein: O00488

ZNF593, Zinc finger protein 593, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF593O00488 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF593O00488 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms