Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms