Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PCH4 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PCH4 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PCH4 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PCH4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PCH4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PCH4 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PCH4 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PCH4 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PCH4 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PCH4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PCH4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PCH4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PCH4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PCH4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PCH4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PCH4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PCH4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PCH4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9PCH4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PCH4 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PCH4 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PCH4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PCH4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PCH4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PCH4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PCH4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PCH4 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PCH4 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PCH4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PCH4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PCH4 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PCH4 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PCH4 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PCH4 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PCH4 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PCH4 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PCH4 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PCH4 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PCH4 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PCH4 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PCH4 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PCH4 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PCH4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PCH4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PCH4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PCH4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9PCH4 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PCH4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PCH4 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PCH4 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PCH4 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PCH4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PCH4 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms