Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms