Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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