Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 204.5 ms