Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU3Q9UQ49 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms