Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MLH3Q9UHC1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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