Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms