Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms