Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms