Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL11Q9NVR0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL11Q9NVR0 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms