Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms