Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYLDQ9NQC7 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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