Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms