Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR7

DDX24, ATP-dependent RNA helicase DDX24, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX24Q9GZR7 TNNT1-217ENST00000593194 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 222.72■■□□□ 1.232e-10■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.12e-10■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.832e-10■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 TNNT1-207ENST00000587089 880 ntTSL 519.83■□□□□ 0.772e-10■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.772e-10■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 TNNT1-214ENST00000589745 529 ntTSL 218.17■□□□□ 0.52e-10■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.52e-10■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.412e-10■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.372e-10■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 TNNT1-216ENST00000593046 800 ntTSL 216.55■□□□□ 0.242e-10■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.152e-10■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.081e-7■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 SUPT5H-205ENST00000593727 493 ntTSL 38.36□□□□□ -1.071e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 TCF25-205ENST00000562184 634 ntTSL 215.13■□□□□ 0.013e-11■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 UBA6-204ENST00000505673 812 ntTSL 55.45□□□□□ -1.549e-10■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 ATP11B-207ENST00000490303 2290 ntTSL 26.16□□□□□ -1.421e-7■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 SRRM2-212ENST00000572952 1118 ntTSL 215.71■□□□□ 0.112e-33■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.743e-7■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 CPSF6-201ENST00000266679 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.013e-7■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.13e-7■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.983e-7■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.863e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 FCHO2-204ENST00000507345 726 ntTSL 517.3■□□□□ 0.368e-7■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 USP16-202ENST00000399973 581 ntTSL 310.2□□□□□ -0.788e-8■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 USP16-204ENST00000399976 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.948e-8■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.088e-8■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.118e-7■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.178e-8■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 USP16-205ENST00000474835 3835 ntTSL 1 (best)4.32□□□□□ -1.728e-8■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 PPIG-205ENST00000418888 525 ntTSL 416.55■□□□□ 0.242e-7■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 TIAL1-204ENST00000412524 515 ntTSL 55.36□□□□□ -1.551e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 SREBF2-204ENST00000462539 796 ntTSL 28.56□□□□□ -1.046e-7■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 CTDNEP1-209ENST00000574205 1506 ntTSL 540.15■■■■■ 4.024e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 CTDNEP1-206ENST00000571409 741 ntTSL 536.71■■■■□ 3.474e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.184e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.044e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.914e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 PRKRIP1-205ENST00000477886 986 ntTSL 1 (best)28.73■■■□□ 2.194e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 EEF1D-217ENST00000526786 1246 ntTSL 227.94■■■□□ 2.064e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 TMBIM1-211ENST00000440422 659 ntTSL 527.85■■■□□ 2.054e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.014e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 SAP30BP-212ENST00000580322 1558 ntTSL 527.35■■□□□ 1.974e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.944e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.934e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.94e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 BMI1-209ENST00000602523 748 ntTSL 1 (best)26.47■■□□□ 1.834e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 CXXC5-209ENST00000507139 472 ntTSL 426.23■■□□□ 1.794e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.694e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.694e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 AC091390.4-203ENST00000492837 602 ntTSL 225.04■■□□□ 1.64e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.534e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.524e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 PNCK-218ENST00000462280 704 ntTSL 324.28■■□□□ 1.484e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.464e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 GARS-203ENST00000454308 814 ntTSL 524.08■■□□□ 1.454e-6■□□□□ 11.1
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DDX24Q9GZR7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.414e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 SIN3B-212ENST00000602204 517 ntTSL 223.86■■□□□ 1.414e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 EEF1D-235ENST00000530848 688 ntTSL 323.42■■□□□ 1.344e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 SAP30BP-213ENST00000580484 686 ntTSL 323.3■■□□□ 1.324e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.28■■□□□ 1.324e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.194e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.164e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.154e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.154e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.134e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 PSMC3IP-207ENST00000589505 1244 ntTSL 221.99■■□□□ 1.114e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 PSMC3IP-209ENST00000590931 1049 ntTSL 1 (best)21.99■■□□□ 1.114e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 PSMC3IP-206ENST00000588544 902 ntTSL 1 (best)21.99■■□□□ 1.114e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.094e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.084e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.044e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.034e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 EEF1D-249ENST00000533749 633 ntTSL 521.44■■□□□ 1.024e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 ANKRD11-214ENST00000568100 878 ntTSL 221.4■■□□□ 1.024e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 IDH2-204ENST00000560061 1449 ntTSL 221.38■■□□□ 1.014e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 COMMD3-BMI1-201ENST00000417470 745 ntTSL 521.25■□□□□ 0.994e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.994e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 SAP30BP-226ENST00000584861 579 ntTSL 221.12■□□□□ 0.974e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 EEF1D-206ENST00000524397 957 ntTSL 320.98■□□□□ 0.954e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 EEF1D-224ENST00000529007 861 ntTSL 220.98■□□□□ 0.954e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.954e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 PLXNA1-204ENST00000505278 536 ntTSL 420.97■□□□□ 0.954e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 DDX11-226ENST00000543756 613 ntTSL 320.96■□□□□ 0.954e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 EEF1D-221ENST00000528382 308 ntTSL 520.81■□□□□ 0.924e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 SAP30BP-201ENST00000293208 1272 ntTSL 520.64■□□□□ 0.894e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.864e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 EEF1D-250ENST00000533833 831 ntTSL 520.45■□□□□ 0.864e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 CLPTM1L-207ENST00000506641 792 ntTSL 520.35■□□□□ 0.854e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.834e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.824e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.824e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.774e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 SAP30BP-204ENST00000577292 1097 ntTSL 219.82■□□□□ 0.764e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 SAP30BP-221ENST00000583536 1000 ntTSL 319.82■□□□□ 0.764e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 SAP30BP-219ENST00000583170 553 ntTSL 419.82■□□□□ 0.764e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 CXXC5-202ENST00000502295 503 ntTSL 419.8■□□□□ 0.764e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 ANKRD11-205ENST00000562194 618 ntTSL 319.68■□□□□ 0.744e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 COMMD3-BMI1-204ENST00000489125 329 ntTSL 219.52■□□□□ 0.724e-6■□□□□ 11.1
DDX24Q9GZR7 AP5Z1-207ENST00000496303 5660 ntTSL 219.51■□□□□ 0.714e-6■□□□□ 11.1
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