Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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IFT27Q9BW83 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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