Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms