Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms