Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms