Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms