Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PRPF18Q99633 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PRPF18Q99633 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PRPF18Q99633 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PRPF18Q99633 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PRPF18Q99633 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PRPF18Q99633 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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