Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR9

APOLD1, Apolipoprotein L domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOLD1Q96LR9 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOLD1Q96LR9 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOLD1Q96LR9 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOLD1Q96LR9 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOLD1Q96LR9 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOLD1Q96LR9 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOLD1Q96LR9 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APOLD1Q96LR9 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOLD1Q96LR9 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOLD1Q96LR9 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOLD1Q96LR9 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOLD1Q96LR9 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOLD1Q96LR9 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOLD1Q96LR9 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOLD1Q96LR9 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOLD1Q96LR9 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOLD1Q96LR9 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOLD1Q96LR9 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOLD1Q96LR9 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOLD1Q96LR9 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APOLD1Q96LR9 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APOLD1Q96LR9 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOLD1Q96LR9 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOLD1Q96LR9 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APOLD1Q96LR9 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOLD1Q96LR9 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOLD1Q96LR9 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOLD1Q96LR9 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOLD1Q96LR9 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APOLD1Q96LR9 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOLD1Q96LR9 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOLD1Q96LR9 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOLD1Q96LR9 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms