Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms