Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms