Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms