Protein–RNA interactions for Protein: Q8N414

PGBD5, PiggyBac transposable element-derived protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD5Q8N414 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGBD5Q8N414 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms