Protein–RNA interactions for Protein: Q8N402

Putative uncharacterized protein LOC388882, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N402 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8N402 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8N402 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8N402 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8N402 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Q8N402 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Q8N402 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Q8N402 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Q8N402 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Q8N402 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8N402 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8N402 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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