Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMNTD2Q8IXW0 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms