Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
P3H3Q8IVL6 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
P3H3Q8IVL6 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms