Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms