Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms