Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms