Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms