Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTQ0

TTC39B, Tetratricopeptide repeat protein 39B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39BQ5VTQ0 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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TTC39BQ5VTQ0 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC39BQ5VTQ0 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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