Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms