Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms