Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms