Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms