Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP13-4Q3LI77 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms