Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SPHKAPQ2M3C7 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPHKAPQ2M3C7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPHKAPQ2M3C7 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SPHKAPQ2M3C7 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPHKAPQ2M3C7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPHKAPQ2M3C7 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SPHKAPQ2M3C7 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPHKAPQ2M3C7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPHKAPQ2M3C7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPHKAPQ2M3C7 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPHKAPQ2M3C7 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPHKAPQ2M3C7 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SPHKAPQ2M3C7 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SPHKAPQ2M3C7 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPHKAPQ2M3C7 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPHKAPQ2M3C7 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPHKAPQ2M3C7 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPHKAPQ2M3C7 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
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