Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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