Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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