Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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