Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SSX1Q16384 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SSX1Q16384 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SSX1Q16384 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SSX1Q16384 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SSX1Q16384 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SSX1Q16384 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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