Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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