Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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CYTH1Q15438 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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CYTH1Q15438 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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CYTH1Q15438 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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CYTH1Q15438 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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CYTH1Q15438 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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CYTH1Q15438 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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CYTH1Q15438 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms