Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLR1Q15399 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TLR1Q15399 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TLR1Q15399 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TLR1Q15399 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TLR1Q15399 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TLR1Q15399 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TLR1Q15399 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TLR1Q15399 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TLR1Q15399 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TLR1Q15399 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TLR1Q15399 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TLR1Q15399 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TLR1Q15399 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TLR1Q15399 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TLR1Q15399 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TLR1Q15399 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TLR1Q15399 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TLR1Q15399 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TLR1Q15399 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TLR1Q15399 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
TLR1Q15399 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TLR1Q15399 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TLR1Q15399 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TLR1Q15399 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TLR1Q15399 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TLR1Q15399 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TLR1Q15399 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TLR1Q15399 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TLR1Q15399 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TLR1Q15399 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TLR1Q15399 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TLR1Q15399 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TLR1Q15399 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TLR1Q15399 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms