Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
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