Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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PTPRRQ15256 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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PTPRRQ15256 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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PTPRRQ15256 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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PTPRRQ15256 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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